ｸﾞﾗﾑ陰性菌とはｸﾞﾗﾑ染色においてｸﾘｽﾀﾙﾊﾞｲｵﾚｯﾄによる染色が脱色される細菌の総称です。ｸﾞﾗﾑ陽性菌ではｸﾘｽﾀﾙﾊﾞｲｵﾚｯﾄは脱色されません。ｸﾞﾗﾑ染色試験では対比染色として通常はｻﾌﾗﾆﾝがｸﾘｽﾀﾙﾊﾞｲｵﾚｯﾄの後に加えられ、全てのｸﾞﾗﾑ陰性菌は赤あるいは桃色に染色され、ｸﾞﾗﾑ陽性菌は紺青色または紫色に染色されます。
ｸﾞﾗﾑ陰性菌：細胞質性の膜、薄いﾍﾟﾌﾟﾁﾄﾞｸﾞﾘｶﾝ層
球菌：性行為感染症（淋菌）、髄膜炎（髄膜炎菌）、呼吸器症状（ｶﾀﾗﾘｽ菌）
桿菌：多数存在。呼吸器系はｲﾝﾌﾙｴﾝｻﾞ菌、肺炎桿菌ﾚｼﾞｵﾈﾗ･ﾆｭｰﾓﾌｨﾗ、緑膿菌などがあり、泌尿器系は大腸菌、ﾐﾗﾋﾞﾘｽ変形菌、ｾﾗﾁｱ･ﾏﾙｾｯｾﾝｽなど。消化器系はﾍﾘｺﾊﾞｸﾀｰ･ﾋﾟﾛﾘ､ｹﾞﾙﾄﾈﾙ菌、ﾁﾌｽ菌など。
ｸﾞﾗﾑ陽性菌：外膜を持たない、厚いﾍﾟﾌﾟﾁﾄﾞｸﾞﾘｶﾝ層の存在
球菌：ｽﾄﾚﾌﾟﾄｺｯｶｽ属とｽﾀﾌｨﾛｺｯｶｽ属
桿菌：ｺﾘﾈﾊﾞｸﾃﾘｳﾑ属とﾘｽﾃﾘｱ属（芽胞なし）ﾊﾞｼﾗｽ属とｸﾛｽﾄﾘｼﾞｳﾑ属（芽胞を形成）。
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